Volcano Plot Labeler 是一款专为生物信息学研究人员设计的自动化工具，用于在火山图中智能标注最显著的差异表达基因。它通过结合统计显著性与效应大小（fold change），自动识别出最具生物学意义的基因，并以清晰、无重叠的方式为其添加标签和引导线。该工具采用先进的排斥算法，确保标签布局合理，避免视觉混乱，极大提升了科研图表的可读性和专业性。用户只需提供标准的差异表达分析结果文件（如 DESeq2 输出），即可快速生成高质量标注后的火山图，适用于转录组学、基因组学等高通量数据分析场景。其设计兼顾灵活性与易用性，支持多种参数配置，满足不同实验需求。
核心功能特点
- 基于 p 值和 log2 fold change 自动筛选前10个最显著基因
- 采用力导向排斥算法防止标签重叠，优化可视化布局
- 支持自定义阈值、字体样式及图形尺寸等参数
- 兼容 PNG、PDF、SVG 等多种图像输出格式
- 提供命令行与 Python API 两种调用方式，适配不同工作流
适用场景
Volcano Plot Labeler 主要面向需要进行差异表达基因可视化的科研人员，尤其适用于转录组测序（RNA-seq）数据分析后的结果展示。在完成如 DESeq2、edgeR 等工具的差异分析后，研究者常需绘制火山图以直观呈现基因上调、下调及显著性分布。该工具可自动突出显示关键候选基因，减少手动标注的时间成本与主观偏差，提升论文或报告中的图表质量。此外，在药物靶点发现、疾病标志物筛选等研究中，快速生成清晰标注的火山图有助于加速数据解读与决策过程。对于批量处理多个样本或条件对比的情况，其命令行接口也便于集成到自动化分析流程中，实现高效、标准化的结果输出。