菌种鉴定自动化工具 Strain Identification BLAST Skill 是一款专为微生物研究设计的智能分析平台，旨在将传统耗时的菌株鉴定流程转化为高效、标准化的自动化操作。该工具通过解析常见的测序文件格式（如 .seq 和 .fasta），自动调用 NCBI 在线数据库进行序列比对，快速定位目标菌株的遗传信息。随后，系统会生成可直接用于钉钉表格的数据结构，并基于用户提供的 Word 模板自动生成完整的菌种鉴定报告，实现从原始数据到正式文档的全流程闭环。这一设计不仅大幅提升了科研效率，也确保了鉴定结果的一致性和可追溯性，特别适合需要批量处理样本的研究团队或实验室环境。
核心功能特点
- 支持解析 .seq 和 .fasta 格式的测序文件，兼容主流测序输出格式
- 自动执行 NCBI 在线 BLAST 比对，获取高精度序列相似性与覆盖度数据
- 一键生成钉钉表格结构化数据，便于团队协作与数据录入
- 基于自定义 Word 模板自动生成标准化菌种鉴定报告，包含样品编号、鉴定结论等关键信息
- 参数化配置，支持灵活指定文件路径与模板路径，适配不同实验场景
适用场景
Strain Identification BLAST Skill 特别适用于微生物学、食品科学、环境监测及临床检验等领域中频繁需要进行菌株鉴定的工作场景。例如，在食品安全检测中，实验室每日需对大量食品样本进行致病菌筛查，传统方法依赖人工比对与报告撰写，耗时且易出错；而使用该工具可快速完成从测序文件到鉴定报告的转化，显著缩短检测周期。在科研项目中，研究人员常需同时处理数十甚至上百个菌株样本，手动整理数据极易导致遗漏或混淆，而该工具通过自动化流程确保每个样本均有完整记录。此外，对于高校教学实验室或企业质检部门而言，其无需复杂编程知识即可部署使用，降低了技术门槛，使非专业人员也能高效开展菌株鉴定工作，极大提升了整体科研与生产管理的规范化水平。